Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP11BQ9Y2G3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP11BQ9Y2G3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms