Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms