Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF9BQ9UPX0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms