Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAK1Q9UPV9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms