Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SORCS3Q9UPU3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms