Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDZRN3Q9UPQ7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZRN3Q9UPQ7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms