Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM35Q9UPQ4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
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