Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms