Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1RE1Q9UN81 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms