Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHA12Q9UN75 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHA12Q9UN75 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms