Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI1

NWD2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD2Q9ULI1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NWD2Q9ULI1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NWD2Q9ULI1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NWD2Q9ULI1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms