Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYH13Q9UKX3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYH13Q9UKX3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms