Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPUSD1Q9UJJ7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms