Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms