Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN11AQ9UI33 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCN11AQ9UI33 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms