Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHORDC1Q9UHD1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms