Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms