Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DBF4Q9UBU7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms