Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC6Q9UBN7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms