Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms