Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRACLQ9P1F3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRACLQ9P1F3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRACLQ9P1F3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRACLQ9P1F3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRACLQ9P1F3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRACLQ9P1F3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRACLQ9P1F3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRACLQ9P1F3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRACLQ9P1F3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRACLQ9P1F3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRACLQ9P1F3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRACLQ9P1F3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRACLQ9P1F3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABRACLQ9P1F3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms