Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms