Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRN3Q9NYV6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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RRN3Q9NYV6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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