Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNK4Q9NYG8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms