Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH5Q9NX47 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH5Q9NX47 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms