Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3EQ9NVU0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR3EQ9NVU0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms