Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ASF1BQ9NVP2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms