Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC87Q9NVE4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC87Q9NVE4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC87Q9NVE4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC87Q9NVE4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC87Q9NVE4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC87Q9NVE4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC87Q9NVE4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC87Q9NVE4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC87Q9NVE4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC87Q9NVE4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC87Q9NVE4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC87Q9NVE4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC87Q9NVE4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms