Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP5S1Q9NUS5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms