Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ9

FAM49B, Protein FAM49B, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49BQ9NUQ9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM49BQ9NUQ9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM49BQ9NUQ9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms