Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF3Q9NR23 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms