Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ASCL3Q9NQ33 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ASCL3Q9NQ33 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms