Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FANCFQ9NPI8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FANCFQ9NPI8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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