Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB9BQ9NP90 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms