Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCB6Q9NP58 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB6Q9NP58 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB6Q9NP58 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB6Q9NP58 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB6Q9NP58 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB6Q9NP58 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB6Q9NP58 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB6Q9NP58 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB6Q9NP58 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB6Q9NP58 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB6Q9NP58 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB6Q9NP58 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms