Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER2Q9H7U1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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