Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms