Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SENP3Q9H4L4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SENP3Q9H4L4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms