Protein–RNA interactions for Protein: Q9H478

KCNQ1DN, KCNQ1 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DNQ9H478 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KCNQ1DNQ9H478 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCNQ1DNQ9H478 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms