Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EHD4Q9H223 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EHD4Q9H223 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms