Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFDQ9GZP0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFDQ9GZP0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFDQ9GZP0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms