Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2J2Q9GZM3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR2J2Q9GZM3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms