Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR12Q9C0I1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR12Q9C0I1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms