Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRCC1Q9C099 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms