Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRNKL1Q9BZJ0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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