Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PBX4Q9BYU1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms