Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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KRTAP9-3Q9BYQ3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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KRTAP9-3Q9BYQ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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