Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GSDMCQ9BYG8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms