Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHANK3Q9BYB0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHANK3Q9BYB0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHANK3Q9BYB0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms