Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SCAPERQ9BY12 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SCAPERQ9BY12 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCAPERQ9BY12 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms